MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 35282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018630	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	410475458
2	NC_018630	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475458
3	NC_018630	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
4	NC_018630	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
5	NC_018630	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
6	NC_018630	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	410475458
7	NC_018630	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
8	NC_018630	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
9	NC_018630	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	410475458
10	NC_018630	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
11	NC_018630	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	410475458
12	NC_018630	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475458
13	NC_018630	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475458
14	NC_018630	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
15	NC_018630	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475458
16	NC_018630	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475458
17	NC_018630	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	410475458
18	NC_018630	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475458
19	NC_018630	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
20	NC_018630	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	410475458
21	NC_018630	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	410475458
22	NC_018630	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	410475458
23	NC_018630	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	410475458
24	NC_018630	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	410475458
25	NC_018630	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475458
26	NC_018630	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410475459
27	NC_018630	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	410475459
28	NC_018630	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
29	NC_018630	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	410475459
30	NC_018630	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
31	NC_018630	TTG	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
32	NC_018630	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
33	NC_018630	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
34	NC_018630	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475459
35	NC_018630	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
36	NC_018630	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	410475459
37	NC_018630	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475459
38	NC_018630	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475459
39	NC_018630	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	410475459
40	NC_018630	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
41	NC_018630	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	410475459
42	NC_018630	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
43	NC_018630	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475459
44	NC_018630	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475459
45	NC_018630	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475459
46	NC_018630	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	410475459
47	NC_018630	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475459
48	NC_018630	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	410475459
49	NC_018630	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	410475459
50	NC_018630	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475459
51	NC_018630	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
52	NC_018630	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
53	NC_018630	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	410475460
54	NC_018630	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	410475460
55	NC_018630	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475460
56	NC_018630	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475460
57	NC_018630	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475460
58	NC_018630	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
59	NC_018630	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
60	NC_018630	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
61	NC_018630	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475461
62	NC_018630	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	410475461
63	NC_018630	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
64	NC_018630	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410475461
65	NC_018630	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
66	NC_018630	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
67	NC_018630	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	410475461
68	NC_018630	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
69	NC_018630	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
70	NC_018630	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475461
71	NC_018630	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	410475461
72	NC_018630	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	410475461
73	NC_018630	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	410475461
74	NC_018630	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
75	NC_018630	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410475461
76	NC_018630	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475461
77	NC_018630	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475461
78	NC_018630	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
79	NC_018630	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475461
80	NC_018630	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	410475461
81	NC_018630	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	410475462
82	NC_018630	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	410475462
83	NC_018630	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	410475462
84	NC_018630	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475462
85	NC_018630	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	410475462
86	NC_018630	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	410475462
87	NC_018630	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	410475462
88	NC_018630	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
89	NC_018630	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
90	NC_018630	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475462
91	NC_018630	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475462
92	NC_018630	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
93	NC_018630	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475462
94	NC_018630	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
95	NC_018630	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475462
96	NC_018630	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475462
97	NC_018630	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
98	NC_018630	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
99	NC_018630	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
100	NC_018630	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410475463
101	NC_018630	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
102	NC_018630	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
103	NC_018630	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410475463
104	NC_018630	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
105	NC_018630	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	410475463
106	NC_018630	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410475463
107	NC_018630	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	410475463
108	NC_018630	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
109	NC_018630	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475463
110	NC_018630	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	410475463
111	NC_018630	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
112	NC_018630	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	410475463
113	NC_018630	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	410475463
114	NC_018630	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
115	NC_018630	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
116	NC_018630	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
117	NC_018630	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
118	NC_018630	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
119	NC_018630	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
120	NC_018630	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	410475463
121	NC_018630	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	410475463
122	NC_018630	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410475463
123	NC_018630	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	410475463
124	NC_018630	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410475463
125	NC_018630	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410475463
126	NC_018630	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410475463
127	NC_018630	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410475463
128	NC_018630	AG	3	6	6391	6396	50 %	0 %	50 %	0 %	410475463
129	NC_018630	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410475463
130	NC_018630	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410475463
131	NC_018630	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	410475463
132	NC_018630	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	410475463
133	NC_018630	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
134	NC_018630	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	410475463
135	NC_018630	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
136	NC_018630	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
137	NC_018630	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
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142	NC_018630	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475463
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266	NC_018630	ATG	2	6	12829	12834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410475470
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